La bandera de Jalisco conocida y utilizada en la actualidad, tiene una historia joven.
Es un rectángulo dividido en dos franjas verticales de medidas idénticas con los colores en el siguiente orden a partir del asta: azul y oro y en el centro el escudo de armas oficial con un diámetro de tres cuartas partes de ancho de una franja.
Se usa de manera oficial apenas desde 2008.
Está basada en un diseño propuesto tras la independencia de México por Prisciliano Sánchez, Gobernador de Jalisco de 1825 a 1826. Esta sería, según su propuesta, una bandera de transición para el Estado, y se asemeja a la que se instauró como oficial ya en tiempos modernos.
Aquella constaba de tres franjas horizontales, en color azul marino en la superior e inferior y en oro la central con el Escudo de Armas al centro de donde se retoman los colores del estandarte de armas del Reino de Galicia.